然而，在正式开始筹建军队的过程中，马超却拒绝使用“马家军”这个名号。
相反，他坚定保持人民军的原有称号，来彰显他对这支军队的期许。
他给北京五军都督府送去的将领名单中，赵大龙和伊宝忠被委以重任，分别担任了人民军守备职务。
李大虎、杨致远、孔令久、徐小虎四人，则被他任命为人民军的把总，肩负起领导军队的重任。
王先生凭借着他的谋略，被编入了人民军的总参谋部；母贤君则因其出色的后勤组织能力，被编入了人民军的后勤保障部；
马强作为马超最可信任的人，正式成为了马超的影子，被编入了人民军的情报部。
他们都被授予了副守备的职务，成为了人民军中的中坚力量。
人民军三个师的编制保持不变，依然按照先前的任命被称为团长、营长、排长和班长。
马超这样做，既有助于保持人民军改编后的战斗秩序和组织框架，又可以使人民军有别于大明国的军队。
这些军职与大明朝廷的副把总、哨官、队长、什长相对应，就意味着他们正式成为了大明国边军，有了保境安民的法理支持。
黄埔学校中的学员也将随军一同北上，他们被暂时编制为直属教导大队，由马超本人亲自指挥和管理。
这样一来，那些年轻的学员们，就能直接参与到大军团训练中，在实战中得到锻炼和成长，为毕业后分配到军中任职打下一个良好的基础。
在经过深思熟虑和众人的讨论之后，马超做出了一个艰难的决定：
“全面放弃安山镇根据地。”
然而，他也没有抛弃那些不愿离开故土的士兵们。
授权李二虎组建二虎山守备营，带领六百故土难离的士兵，继续留在二虎山根据地内发展。
所有人民军战兵和辅兵接到命令后，纷纷拉着他们积攒的物资和装备，按期集结于马家村内接受整编。
任命伊宝忠为第一师师长，麾下设有骑兵团，火枪兵团，火炮兵团。
任命赵大龙为第二师师长，麾下设有火枪兵团，长枪兵团，刀盾兵团。
任命杨致远为第三师师长，麾下设有火枪兵团，弓箭兵团，工程兵团。
马超将直属教导大队细分为三个部分：参谋部、战术部以及政治部。
依据每名学员的专长与个人喜好，安排他们进入不同部门学习实习。
面对大明朝廷送来的六万两白银，以及六千石粳米，马超决定全部封存起来，并委托济南府衙代替自己归还给大明朝廷。
他所给出的理由也很简单，大明国内近年来饱受天灾人祸之苦，导致朝廷财政状况陷入困境。
因此，他甘愿倾尽所有家财筹建军队训练，以此为大明朝廷分担压力，替皇帝陛下分忧解难。