在旅途上发生得战斗，是宝可梦训练家的重要修行项目，这不，小智正在与一位路人大叔进行着宝可梦对战。
“妙蛙种子，就决定是你了!”
“铁甲犀牛，上吧！用猛撞攻击……”
随着铁甲犀牛的跑动，地面发生剧烈的颤动，可见铁甲犀牛的吨位不低啊！
“好像发生了地震哎……”小霞抱着波克比，发出一阵感慨，而小刚却抱着身边的大树，像是在规避震动，还不忘出言提醒小智，“铁甲犀牛的猛撞攻击可是很厉害的，要小心啊，小智！”
“上啊，妙蛙种子，使用寄生种子攻击！”不知为何，妙蛙种子并没有依照小智的命令行动，被铁甲犀牛的猛撞攻击撞倒在地。“妙蛙种子！”小智见此担心不已，观战的小霞和小刚也是一阵惊呼，为小智和妙蛙种子担忧，“好快啊！”“铁甲犀牛的等级可是很高的！”
“回来吧，妙蛙种子！”小智见此想收回妙蛙种子，可是却被妙蛙种子躲开，拒绝回到球里，“妙蛙种子，你在干什么？快回来啊！”
“看来妙蛙种子在获胜之前，是不想回到球里面了！”小刚看到妙蛙种子那抗拒的行为，给出了一个解释。
这让路人大叔不免出言调笑，“呵呵呵，竟然不听训练家的话，看来你的教育不够啊！铁甲犀牛，使用猛撞攻击……”
“不可以输，快使用飞叶快刀……”面对着向自己冲撞而来的铁甲犀牛，妙蛙种子背上的种子里，激射出一片片绿叶，如同刀刃般迎向铁甲犀牛，将铁甲犀牛打得前腿抬起，随即使用藤鞭，像抽打陀螺般，攻击铁甲犀牛。
铁甲犀牛的身体如同陀螺般转动起来，一会儿就转晕了过去，路人大叔急忙上前查看情况，“啊！铁甲犀牛！”
“耶！赢了！”取得了对战的胜利，小智欢喜雀跃，妙蛙种子却突然陷入了奇怪的状态，它的身体开始发光，似乎在发生某种变化。
“妙蛙种子，你怎么样？是身体不舒服吗？”小智赶紧把妙蛙种子送往宝可梦中心进行救治。
“这个情况……难道是……”乔伊小姐看到妙蛙种子的反应，心中有了些猜测，不过还是将妙蛙种子推进了检查室进行检查，在妙蛙种子路过的时候，花瓶里的花，竟然奇迹般的开放了。
“你别担心，妙蛙种子没问题的，它只是出现了进化的征兆而已。”乔伊告诉小智，这是妙蛙种子进化前的征兆，而且很快就会发生进化。小智听后激动不已，他期待着看到妙蛙种子进化的那一刻。
“据说，妙蛙种子到达了某个时期，就会不知涌自各处，聚集在一块，举办类似庆祝进化的庆典，这个庆典似乎和月亮的圆缺，星星的运行有关。对了，它不见得是在每年的同样的季节举行的。”
“看来我们好像是迎来了重要的时刻呢！”小刚面带微笑说道。
“好浪漫哦，进化是在哪里发生的呢？”小霞一脸好奇。
“在被称为不思议花园的地方！可是到目前为止，从来都没有人看到过那个地方，所以被认为只是幻影呢！”在乔伊小姐那了解了不思议花园的情况后，众人带着憧憬，各自休息去了。
半夜时分，小智的妙蛙种子竟然被藤蔓抓进了森林里去，雨轩和小智等人踏上了寻找妙蛙种子的旅程。他们穿越了被藤蔓阻挡的森林，翻越了险峻的山脉，历经千辛万苦，终于来到了这个传说中的地方——不思议花园。
这个花园充满了神秘和奇幻，仿佛是大自然的魔法之地。每当月圆之夜，妙蛙种子们都会从四面八方汇聚而来，共同庆祝一次神秘而庄严的进化盛典。
当他们到达花园时，众人看到一群妙蛙种子正在聚集，它们的身上闪烁着神秘的光芒，仿佛在诉说着古老的故事。
然而，就在这时，火箭队三人组乘坐着热气球出现在了上空，开始对聚集的妙蛙种子进行抓捕。